Kromatogram penceresi, bir kromatogramla etkileşim kurmak için kullanılan birincil MassLynx aracıdır. Bu modül, Kromatogram penceresinde daha yaygın olarak gerçekleştirilen kullanıcı görevlerini size gösterecektir. Konular, temel görüntüleme seçeneklerinden kromatogram integrasyonuna kadar uzanır.